Adding start of x86_64 port

Merge branch 'master' of git://git.ucc.asn.au/acess2

misc

Disabled ATA debug, turned FAT Debug on, misc in IPStack/TCP

Updated FAT filesystem driver to not cache the FAT if the disk is too large

Fixed bug in keyboard driver on real hardware (aux p/s2 port code)

Fixes for running on an InitRD, moved kernel echo switch to later

Fixed some bugs in ARP and TCP Code
- also I need to learn not to use "git commit -a" when using git add.
- Last commit also had some huge changes to the Video architecture
 > Made the video mode only describe the resolution and colour depth.
 > Text/Framebuffer/3D are now controled via an IOCtl that swaps buffer modes
 > An IOCtl (still to be put in) will provide feature flags for the VTerm to read

Fixed a bug in the heap manager where if an exact match of the block is found, garbage is returned

Cleaning up more Log( calls with Log_*(
- TODO: Move the module load messages to Log_Notice instead of Log_Log

Fixed VM8086/Vesa memory allocation bug

Many changes, Mostly working on improving the BootConf script engine.
- Added variable support and function returns
- Working on VESA driver, still a little buggy
- Misc changes in other places

Improved padding code in Debug_Fmt
- Also separated 's' and the general string printing

Fixed keyboard bug where keypresses were not being registered, working on libreadline
- Keyboard now reads from 0x60 in keyboard setup to clear keyboard IRQ buffer.
- libreadline is unstable, but supports command histories (just don't try to edit
  a command in the history)

Fixes to x86 error and interrupt handling
- Fixed double fault handler so it actually works
- I (thePowersGang/John Hodge) am an idiot, As you will see from Kernel/arch/x86/desctab.asm
  I forgot to set the data segment selectors to kernel values when handling interrupts,
  this caused IRQs and faults that occured in vm8086 mode to triple fault.
- Other changes to logging, moving more log/notice messages to the Log_* functions
- Untested fixes to TCP's Acknowledgement number code
 > TODO Check wether to ACK a packet on arrival, or once it's added to the client buffer.
- Also fixed some bugs in the thread Sleep/Wake functions that were exposed by
  the vm8086 driver.

Updated gitignore rules

VM8086 Support, Starting on VESA Driver
- VM8086 required some changes to CPU fault code
- Re-enabled kernel magic combos in keyboard driver
- Slight changes to Memory APIs (changed MM_MapHWPage to MM_MapHWPages)

Misc Changes
- Moved USB core to a new folder,
- Slight changes to Ext2 driver
- Slight changes in BochsGA driver
- Added a cache field to the tVFS_Node that can be assumed to be a heap address or NULL
 > Allows easier cleanup of per-fs buffers when a node is freed
- Added the start of a VM8086 driver for BIOS calls

Disable debug in FAT

Added mboot2 header

Bugfixing FAT Driver, Addint Multiboot2 Support
- I've decided not to support writing to FAT filesystems

More work on the FAT driver, more messy, but more complete
- Also did some documentation changes to the tVFS_Node structure

Working on cleaning up the FAT driver, but atm it's more messy than ever.
<UNTESTED COMMIT>

Cleanups in FAT driver
- Minor change to acess.h

Updating drivers to use the Log_ functions instead of Log() and Warning()

Fixed logging print not working, cleaned up debug
- Fixed FDD Driver always timing out on a read/write
- Added an error report to the FDD read/write method

Fixed lack of error handling in FDD driver, also abstracted the Read/Write
operations into one common function.

Cleanup Commit
- Adding a hell of a lot of files to the tree
 > EDI Interface (Incomplete)
 > AxWin Shell (Incomplete, Needs to be rewritten)
 > AxWin library and headers
- Restructuring AxWin to be non-windowed
- Changes to IpStack
- Fixes to kernel logging
- Added APIDoc files
- Cleaning up ifconfig and other helpers

Misc Changes, Added Logging Subsystem, Fixes to InitRD, Working on RTL8139 driver

Bugfixing initrd and ld-acess
- ld-acess passed NULL to SysLoadBin if the file is not found
- InitRD ignored Offset in ReadFile

Multiple fixes
- Fixed bug in FDD driver where motor was stopped during a read operation
- Moved PCI and DMA to be loaded like any other module/driver
- Added PCI as a dependency to BochsGA and ATA driver, Added DMA to FDD
- Fixed PCI not scanning the full length of the bus (only scanned 10, not 32 devices per bus)

Various changes, most of them involving the FAT and Ext2 Drivers, adding write support
- FAT Now has rudimentary write support (file size still isn't updated)
- Added InitRD to the tree
- Slight changes to the Module build system
- Set modules to use -O3 and fixed the bugs that showed

Added file extending to Ext2 Driver, also cleaned up the FS_Ext2 source
- Fixed an off-by-one error when calculating allocated blocks
- Fixed using a fixed 256 blocks per indirect block (now depends on the block size)

Moar cleanupe

Removed FDD_AcquireSpinlock and FDD_FreeSpinlock, replacing them with LOCK() and RELEASE()

Cleaning up FDD driver, removed local cache in favour of iocache.h

Misc changes

More documentation, mostly to the PCI

Commenting for new function

Restructured Modules_LoadBuiltins to load modules in the order they are linked in.
- Also moved vterm.o to be linked earlier
- Removed a newline from a Log() in ne2000.c

Work on documentation

Changes to the module loader to handle specific errors from modules
- Changed MODULE_INIT_SUCCESS to MODULE_ERR_OK and added other MODULE_ERR_* values

Slight Changes, mostly fixing CPU error reporting
- Also attempted to fix the Qemu kb bug
- Added a todo to the FDD driver

IPv6, and I need to learn to compile before commiting

Starting on a NFS driver

doxygen fixes

More work on TCP, Connection is successfully established, but problemw with ACKing packets.
- RST is sent after ACKing first data packet.
- Also did some changes to Debug_DumpHex and Threads_Get*

Bugfixing and testing TCP stack
- Also fixed build process

More work on TCP, untested and almost complete

More work on TCP, approaching usable (untested)

Cleanup commit, fixes to UDP, TCP and ICMP
- Basicly cleaning up commented out code and potential bugs
- More work on TCP support

Removed debug from Network/NE2000/ne2000.c

UDP Packets are now sent and recieved correctly (server not tested)
- Also did some work on USB, only minor.
- Fixed a bug in IPStack/link.c that passed a non-aligned packet to the interface.
- Fixed channel being skipped if the IP _matches_ (should be skipped if it doesn't)
"Yo dawg, I heard you liek packets, so I sent you one"

More fixups to ARP and UDP (udp still buggy)

Working on UDP, removed debug from some code, fixed ARP setting hwtype to 0x100 (should be 1)
- Other Misc changes

More work on TCP, splitted UDI arch dependent out of udi.h, slight work on AxWin

More work on TCP, still not usable

Work on IP/TCP Stack
- TCP now registered with IPv4
- Added debug code and started on TCP server support
- Fixed bitfield error (removed the bitfields for portability)

Helps if I add it to the main makefile

Removed the need to alter acess.ld for each build environment

More work on IPStack, TCP and UDP slowly moving along

Cleanups that will hopefully allow compilation in more strict environments

Fixed and improved Ping support
- BUG: ARP requests time out for some reason, todo check on other networks
- Also updated the readme for better support when building

More work on the IP Stack, now responds to pings
- Also fixed bug in NE2000 driver that resent the first packet
  on each subsequent send.

Fixed IPStack's ID showing as IDENT

More additions

Cleaning up unadded files

Working on GUI, side changes to the message passing

Reorganised the modules directory, started serious work on GUI support
- Cleaning up and bugfixing VTerm graphics support

Altered & Renamed LookupString, Added DrvUtil_SetIdent
- Both now check the user memory before using it

I really need to learn to compile test before commiting

Updated gitignore rules, cleaned up MBR parsing

Started splitting ATA driver into separate files

Renamed ATA core to main.c

Moved ATA driver out of Kernel tree
- Also changed VER3 macro to VER2 for compatability with MODULE_DEFINE

Bugfixes and debug cleanup
- Cleanup in threads.c
- Fixed ACL/Permissions bugs in VFS
- Also fixed instaces where tVFS_Node methods were called without NULL checking

Multi-user testing and bugfixing
- Actually changes the UID now
- Added stub normal user 'tpg', no password

More debug in PE loader

Exteding Driver interface
- Changed 4-byte ID to a 31 byte string (32 with NULL terminator)
- Created a macro for the version numbers

Comment/documentation change to the VFS

Fixes and logging

Changes and Features to IPStack
- Added 'ping' ioctl and required calls, currently incomplete

Adding PE file support
- Also added binary register function (now modules can handle binary files)

Added support for dynamic registration of module loaders
- Also updated .gitignore to exclude more object files
- UDI is now a dynamic module

Adding `udisetup` (and required linker script)

Slight changes to UDI structures and logging

Fixed Double-Relocation in modules.c (edited bin/elf.c to find this)

More work on UDI, cleanup and pseudod should now load.
- Also added a NULL check to ELF_GetSymbol

Added cb.o to the UDI objects list

More UDI work
- GIO Metalanguage
- CB Functions
- Also added the UNIMPLEMENTED() macro for unimplemented functions

More work on UDI support

More work on UDI support, still doesn't load pseudud yet
- Also fixed the FAT ReadDir bug (bad treatment of SPC==1)

Bugfixes and UDI Updates
- Added UDI to the tree
- Bugfixing FAT filesystem (Fixed EOC handling in FindDir)
 > Still a bug in ReadDir that causes garbage to be read

Ok, this was embarrassing... Added core include file that was renamed
- include/acess.h was renamed (from include/common.h) several commits
  ago and I forgot to add it.

More work on UDI, Added more Login VTerms

Bugfixes, Cleanup and Rewite started on UDI interface
- Fixed bug in mm_virt where the kernel (as 0-1MiB) was being marked COW
  (hence triple faulting)
- Cleaned up /Makefile (now only builds kernel and modules with no target)
- Started rewriting the UDI system

Fixed a bug that caused physical memory allocation to be one-time use

SMP Work (APs now start, just seem to lock up on lgdt, or whatever is at that address)
- Also added support for setting the build architecture in the environment
- Included the Doxygen layout file

More SMP Work, also changed the physical allocator to allocate downwards

Working on Multiprocessing support
- Cleaned up SysFS debug
- Fixed ByteSum() (now returns a byte)
- Added character array functionality to %c (%Nc will print N chacters from the passed array)