Thesis - Seperate file for SEM analysis

Having everything in one massive thesis.tex file is starting to confuse me
I will start to break up into several .tex files and recombine later.

This section needs a *lot* of work. But then, so does everything.

Thesis - Fourier transforming python scripts

Used for analysing SEM images
Not finished?

Need to write clever sounding stuff about this in the thesis.
Can't work out how to phrase it.

Thesis

...AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAHHHHHHHHHH

Merge branch 'master' of git.ucc.asn.au:/matches/honours

This is the thesis

AAAAAAAAAAAA

Automatic commit. Mon Oct  8 12:00:08 WST 2012

Q: What do you call a principal female opera singer whose high C
is lower than those of other principal female opera singers?
A: A deep C diva.

Automatic commit. Mon Oct  8 00:00:02 WST 2012

Q: How does the Polish Constitution differ from the American?
A: Under the Polish Constitution citizens are guaranteed freedom of
speech, but under the United States constitution they are
guaranteed freedom after speech.
-- being told in Poland, 1987

Automatic commit. Sun Oct  7 12:00:08 WST 2012

Having nothing, nothing can he lose.
-- William Shakespeare, "Henry VI"

Automatic commit. Sun Oct  7 00:02:06 WST 2012

You are destined to become the commandant of the fighting men of the
department of transportation.

Merge branch 'master' of git.ucc.asn.au:/matches/honours

Thesis - Oh deary me

Progress? HAHAHAH I laugh in the face of progress

Automatic commit. Sat Oct  6 12:00:10 WST 2012

Q: Why did the programmer call his mother long distance?
A: Because that was her name.

Automatic commit. Sat Oct  6 00:00:05 WST 2012

You can create your own opportunities this week.  Blackmail a senior executive.

Papers - Another one

It's in German. Whoops.

Papers - Add a paper

Automatic commit. Fri Oct  5 12:00:03 WST 2012

Beware of a dark-haired man with a loud tie.

Automatic commit. Fri Oct  5 00:00:03 WST 2012

Beware of a dark-haired man with a loud tie.

Automatic commit. Thu Oct  4 12:00:03 WST 2012

It's all in the mind, ya know.

TCS - Remove all the temporary image files from the movie making

Automatic commit. Thu Oct  4 00:00:10 WST 2012

If you tell the truth you don't have to remember anything.
-- Mark Twain

Parallel Programming - Final version

Finished at 4am on Monday (naturally forgot to commit then)

Thesis - Work

Wrote stuff about metallic black films
Wrote acknowledgements

Ergh

Automatic commit. Wed Oct  3 12:00:08 WST 2012

Your depth of comprehension may tend to make you lax in worldly ways.

Automatic commit. Wed Oct  3 00:00:07 WST 2012

Q: Why don't Scotsmen ever have coffee the way they like it?
A: Well, they like it with two lumps of sugar.  If they drink
it at home, they only take one, and if they drink it while
visiting, they always take three.

Automatic commit. Tue Oct  2 12:00:08 WST 2012

Don't you feel more like you do now than you did when you came in?

Automatic commit. Tue Oct  2 00:00:02 WST 2012

Your aim is high and to the right.

Automatic commit. Mon Oct  1 12:00:07 WST 2012

If more of us valued food and cheer and song above hoarded gold, it would
be a merrier world.
-- J.R.R. Tolkien

Automatic commit. Mon Oct  1 00:00:09 WST 2012

Alimony and bribes will engage a large share of your wealth.

Parallel Programming - Finished OpenMP

I think

Parallel Programming - Finished pthreads

I finally fixed all the stupid bugs in pthreads.
Committing before messing with the openmp version (which surprisingly compiles)

I basically just need to get rid of the busy loop in the openmp version.
I will probably have to completely change the structure or something. Grrr.

Automatic commit. Sun Sep 30 12:00:02 WST 2012

Don't look back, the lemmings are gaining on you.

Automatic commit. Sun Sep 30 00:00:02 WST 2012

Q: Why did the tachyon cross the road?
A: Because it was on the other side.

Automatic commit. Sat Sep 29 12:00:03 WST 2012

The ripest fruit falls first.
-- William Shakespeare, "Richard II"

Automatic commit. Sat Sep 29 00:00:07 WST 2012

Beware of a tall blond man with one black shoe.

Automatic commit. Fri Sep 28 12:00:07 WST 2012

Q: What's a light-year?
A: One-third less calories than a regular year.

Automatic commit. Fri Sep 28 00:00:03 WST 2012

Training is everything.  The peach was once a bitter almond; cauliflower is
nothing but cabbage with a college education.
-- Mark Twain, "Pudd'nhead Wilson's Calendar"

Merge branch 'master' of mussel.ucc.asn.au:matches/honours

Automatic commit. Thu Sep 27 12:00:14 WST 2012

Q: How can you tell when a Burroughs salesman is lying?
A: When his lips move.

Automatic commit. Thu Sep 27 00:00:07 WST 2012

You need no longer worry about the future.  This time tomorrow you'll be dead.

Automatic commit. Wed Sep 26 12:00:07 WST 2012

You can do very well in speculation where land or anything to do with dirt
is concerned.

Automatic commit. Wed Sep 26 00:00:02 WST 2012

Beware the one behind you.

Automatic commit. Tue Sep 25 12:00:08 WST 2012

Q: How does the Polish Constitution differ from the American?
A: Under the Polish Constitution citizens are guaranteed freedom of
speech, but under the United States constitution they are
guaranteed freedom after speech.
-- being told in Poland, 1987

Automatic commit. Tue Sep 25 00:00:02 WST 2012

Another good night not to sleep in a eucalyptus tree.

Automatic commit. Mon Sep 24 12:00:08 WST 2012

It is by the fortune of God that, in this country, we have three benefits:
freedom of speech, freedom of thought, and the wisdom never to use either.
-- Mark Twain

Automatic commit. Mon Sep 24 00:00:08 WST 2012

You are fairminded, just and loving.

Automatic commit. Sun Sep 23 12:00:08 WST 2012

Q: What's yellow, and equivalent to the Axiom of Choice?
A: Zorn's Lemon.

Automatic commit. Sun Sep 23 00:00:07 WST 2012

This night methinks is but the daylight sick.
-- William Shakespeare, "The Merchant of Venice"

Automatic commit. Sat Sep 22 12:00:07 WST 2012

You have a truly strong individuality.

Automatic commit. Sat Sep 22 00:00:07 WST 2012

You are magnetic in your bearing.

Automatic commit. Fri Sep 21 12:00:07 WST 2012

October 12, the Discovery.

It was wonderful to find America, but it would have been more wonderful to miss
it.
-- Mark Twain, "Pudd'nhead Wilson's Calendar"

Automatic commit. Fri Sep 21 00:00:13 WST 2012

Q: How do you catch a unique rabbit?
A: Unique up on it!

Q: How do you catch a tame rabbit?
A: The tame way!

Automatic commit. Thu Sep 20 12:00:02 WST 2012

Next Friday will not be your lucky day.  As a matter of fact, you don't
have a lucky day this year.

Automatic commit. Thu Sep 20 00:00:02 WST 2012

The secret source of humor is not joy but sorrow; there is no humor in Heaven.
-- Mark Twain

Automatic commit. Wed Sep 19 12:00:12 WST 2012

Long life is in store for you.

Parallel Programming - Improve camera UI

Can now fly around (sort of) like Descent games.
Except glut can only handle one key press at a time... pretty terrible
Maybe I'll change it to SDL... But I think I'm getting side tracked

Parallel Programming - Commit before I break everything

About to radically alter structure of pthread program to enable nested threads
Well actually I already started. But oh well.

Santa Claus
 (Just kidding, this is Sam again)

Automatic commit. Thu Sep 13 12:00:07 WST 2012

You will have a long and unpleasant discussion with your supervisor.

Automatic commit. Thu Sep 13 00:00:07 WST 2012

You will be reincarnated as a toad; and you will be much happier.

Automatic commit. Wed Sep 12 12:00:03 WST 2012

An honest tale speeds best being plainly told.
-- William Shakespeare, "Henry VI"

Automatic commit. Wed Sep 12 00:00:12 WST 2012

Q: How does the Polish Constitution differ from the American?
A: Under the Polish Constitution citizens are guaranteed freedom of
speech, but under the United States constitution they are
guaranteed freedom after speech.
-- being told in Poland, 1987

Merge branch 'master' of git.ucc.asn.au:/matches/honours

Parallel Programming - Stuff happened

I'm not sure what.
The new version of pthread (with threads that don't exit) is not as
much faster than the old version as I thought it would be.

Sleep(10);

Sam

Parallel Programming - pthreads version

Implemented multithreaded barrier to save typing the same thing a billion more times

Parallel Programming - Commit before I break things

Going to try and alter pthreads version so that it doesn't keep respawning threads
IE: The same threads are active for the whole program. See which is faster.

Automatic commit. Tue Sep 11 12:00:04 WST 2012

A tall, dark stranger will have more fun than you.

Automatic commit. Tue Sep 11 00:00:04 WST 2012

Artistic ventures highlighted.  Rob a museum.

Testing

Test git pull on motsugo works

Automatic commit. Mon Sep 10 12:00:04 WST 2012

The notes blatted skyward as they rose over the Canada geese, feathered
rumps mooning the day, webbed appendages frantically pedaling unseen
bicycles in their search for sustenance, driven by cruel Nature's maxim,
'Ya wanna eat, ya gotta work,' and at last I knew Pittsburgh.
-- Winning sentence, 1987 Bulwer-Lytton bad fiction contest.

Automatic commit. Mon Sep 10 00:00:08 WST 2012

Q: How many lawyers does it take to change a light bulb?
A: You won't find a lawyer who can change a light bulb.  Now, if
you're looking for a lawyer to screw a light bulb...

Parallel Programming - Trivial

Dear Git,

It has been a while since I sent you a personal message.
I hope this hasn't offended you.

A Deer,
Sam

Parallel Programming - Start OpenMP Version

Almost finished

Automatic commit. Sun Sep  9 12:00:04 WST 2012

When you are about to die, a wombat is better than no company at all.
-- Roger Zelazny, "Doorways in the Sand"

Automatic commit. Sun Sep  9 00:00:04 WST 2012

Sheriff Chameleotoptor sighed with an air of weary sadness, and then
turned to Doppelgutt and said 'The Senator must really have been on a
bender this time -- he left a party in Cleveland, Ohio, at 11:30 last
night, and they found his car this morning in the smokestack of a British
aircraft carrier in the Formosa Straits.'
-- Grand Panjandrum's Special Award, 1985 Bulwer-Lytton
   bad fiction contest.

Merge branch 'master' of git.ucc.asn.au:/matches/honours

Parallel Programming - Tidied things up

Since most of the single thread code can be reused, I put in symbolic links for the mthread version.
I added comments. The programs can be run without graphics. They can also output performance info.

Also wrote python script to get performance information and plot it.
I was going to do the OpenMP version, but got carried away with all the "tidying", so I haven't yet.

Curses.

Automatic commit. Sat Sep  8 12:00:03 WST 2012

You have the capacity to learn from mistakes.  You'll learn a lot today.

Automatic commit. Sat Sep  8 00:00:03 WST 2012

You will have a long and unpleasant discussion with your supervisor.

Automatic commit. Fri Sep  7 12:00:03 WST 2012

You have an unusual magnetic personality.  Don't walk too close to
metal objects which are not fastened down.

Automatic commit. Fri Sep  7 00:00:05 WST 2012

FORTUNE PROVIDES QUESTIONS FOR THE GREAT ANSWERS: #31
A: Chicken Teriyaki.
Q: What is the name of the world's oldest kamikaze pilot?

Parallel Programming - Finished(?) pthread version

Seems to work. Hasn't crashed yet. Seems faster than single-threaded version, but have only looked at side by side graphics drawing.
Need to analyse performance better.

Sam

Parallel Programming - Work on pthreaded version

Create computation thread seperate from graphics (main thread, because apparently Mac OSX doesn't like glut in child threads...
and all the lecturers use Macs). Main thread signals computation thread to quit when exit() is called.

Parallel Programming - Single threaded version done

Graphics and simulation code seperated as much as possible.
Got rid of inconsistancies in original style, made it as similar to my own as possible without insane over engineering.
Only minor amount of over engineering done!

Parallel Programming - Make single threaded version

Trying to modify the template program so that it is
a) actually organised
b) Not as over engineered as my own single threaded version (assignment0)

Anyway, it doesn't compile but at least I started

Sam (who else?)

Automatic commit. Thu Sep  6 12:00:05 WST 2012

My dear People.
My dear Bagginses and Boffins, and my dear Tooks and Brandybucks,
and Grubbs, and Chubbs, and Burrowses, and Hornblowers, and Bolgers,
Bracegirdles, Goodbodies, Brockhouses and Proudfoots.  Also my good
Sackville Bagginses that I welcome back at last to Bag End.  Today is my
one hundred and eleventh birthday: I am eleventy-one today!"
-- J. R. R. Tolkien

Automatic commit. Thu Sep  6 00:00:05 WST 2012

Save energy: be apathetic.

Automatic commit. Wed Sep  5 12:00:03 WST 2012

Ships are safe in harbor, but they were never meant to stay there.

Automatic commit. Wed Sep  5 00:00:03 WST 2012

Someone is speaking well of you.

Automatic commit. Tue Sep  4 12:00:09 WST 2012

Try the Moo Shu Pork.  It is especially good today.

Automatic commit. Tue Sep  4 00:00:06 WST 2012

Q: What looks like a cat, flies like a bat, brays like a donkey, and
plays like a monkey?
A: Nothing.

Merge branch 'master' of git.ucc.asn.au:/matches/honours

Work on thesis

I think the diff will show a depressingly large number of deleted lines, and not very many new lines...

Parallel Programming - Start assignment 1

Needed a -lGLU in the linker flags all along, derp

Automatic commit. Mon Sep  3 12:00:05 WST 2012

Q: What do Winnie the Pooh and John the Baptist have in common?
A: The same middle name.

Automatic commit. Mon Sep  3 00:00:04 WST 2012

You like to form new friendships and make new acquaintances.

Automatic commit. Sun Sep  2 12:00:05 WST 2012

You get along very well with everyone except animals and people.

Automatic commit. Sun Sep  2 00:00:04 WST 2012

They spell it "da Vinci" and pronounce it "da Vinchy".  Foreigners
always spell better than they pronounce.
-- Mark Twain

Automatic commit. Sat Sep  1 12:00:04 WST 2012

Q: What is green and lives in the ocean?
A: Moby Pickle.

Automatic commit. Sat Sep  1 00:00:05 WST 2012

Is this really happening?

Add figures of pressure images

Dear Git,

I am feeling the pressure.

Yours pressured,
Sam

Merge branch 'master' of mussel.ucc.asn.au:matches/honours