Merge branch 'master' of git.ucc.asn.au:/matches/honours

Parallel Programming - Tidied things up

Since most of the single thread code can be reused, I put in symbolic links for the mthread version.
I added comments. The programs can be run without graphics. They can also output performance info.

Also wrote python script to get performance information and plot it.
I was going to do the OpenMP version, but got carried away with all the "tidying", so I haven't yet.

Curses.

Automatic commit. Sat Sep  8 12:00:03 WST 2012

You have the capacity to learn from mistakes.  You'll learn a lot today.

Automatic commit. Sat Sep  8 00:00:03 WST 2012

You will have a long and unpleasant discussion with your supervisor.

Automatic commit. Fri Sep  7 12:00:03 WST 2012

You have an unusual magnetic personality.  Don't walk too close to
metal objects which are not fastened down.

Automatic commit. Fri Sep  7 00:00:05 WST 2012

FORTUNE PROVIDES QUESTIONS FOR THE GREAT ANSWERS: #31
A: Chicken Teriyaki.
Q: What is the name of the world's oldest kamikaze pilot?

Parallel Programming - Finished(?) pthread version

Seems to work. Hasn't crashed yet. Seems faster than single-threaded version, but have only looked at side by side graphics drawing.
Need to analyse performance better.

Sam

Parallel Programming - Work on pthreaded version

Create computation thread seperate from graphics (main thread, because apparently Mac OSX doesn't like glut in child threads...
and all the lecturers use Macs). Main thread signals computation thread to quit when exit() is called.

Parallel Programming - Single threaded version done

Graphics and simulation code seperated as much as possible.
Got rid of inconsistancies in original style, made it as similar to my own as possible without insane over engineering.
Only minor amount of over engineering done!

Parallel Programming - Make single threaded version

Trying to modify the template program so that it is
a) actually organised
b) Not as over engineered as my own single threaded version (assignment0)

Anyway, it doesn't compile but at least I started

Sam (who else?)

Automatic commit. Thu Sep  6 12:00:05 WST 2012

My dear People.
My dear Bagginses and Boffins, and my dear Tooks and Brandybucks,
and Grubbs, and Chubbs, and Burrowses, and Hornblowers, and Bolgers,
Bracegirdles, Goodbodies, Brockhouses and Proudfoots.  Also my good
Sackville Bagginses that I welcome back at last to Bag End.  Today is my
one hundred and eleventh birthday: I am eleventy-one today!"
-- J. R. R. Tolkien

Automatic commit. Thu Sep  6 00:00:05 WST 2012

Save energy: be apathetic.

Automatic commit. Wed Sep  5 12:00:03 WST 2012

Ships are safe in harbor, but they were never meant to stay there.

Automatic commit. Wed Sep  5 00:00:03 WST 2012

Someone is speaking well of you.

Automatic commit. Tue Sep  4 12:00:09 WST 2012

Try the Moo Shu Pork.  It is especially good today.

Automatic commit. Tue Sep  4 00:00:06 WST 2012

Q: What looks like a cat, flies like a bat, brays like a donkey, and
plays like a monkey?
A: Nothing.

Merge branch 'master' of git.ucc.asn.au:/matches/honours

Work on thesis

I think the diff will show a depressingly large number of deleted lines, and not very many new lines...

Parallel Programming - Start assignment 1

Needed a -lGLU in the linker flags all along, derp

Automatic commit. Mon Sep  3 12:00:05 WST 2012

Q: What do Winnie the Pooh and John the Baptist have in common?
A: The same middle name.

Automatic commit. Mon Sep  3 00:00:04 WST 2012

You like to form new friendships and make new acquaintances.

Automatic commit. Sun Sep  2 12:00:05 WST 2012

You get along very well with everyone except animals and people.

Automatic commit. Sun Sep  2 00:00:04 WST 2012

They spell it "da Vinci" and pronounce it "da Vinchy".  Foreigners
always spell better than they pronounce.
-- Mark Twain

Automatic commit. Sat Sep  1 12:00:04 WST 2012

Q: What is green and lives in the ocean?
A: Moby Pickle.

Automatic commit. Sat Sep  1 00:00:05 WST 2012

Is this really happening?

Add figures of pressure images

Dear Git,

I am feeling the pressure.

Yours pressured,
Sam

Merge branch 'master' of mussel.ucc.asn.au:matches/honours

Add figures,

Dear Git,

It figures that I forgot to add some of the figures to git.
Shouldn't the update script have added them? Useless script.

Figuratively,
Sam

Merge branch 'master' of git://git.ucc.asn.au/matches/honours

Work on thesis

Dear Git,

Things are progressing slowly.

Yours slowfully,
Sam

Automatic commit. Fri Aug 31 12:00:07 WST 2012

Stay away from hurricanes for a while.

Automatic commit. Fri Aug 31 00:00:05 WST 2012

Questionable day.

Ask somebody something.

Automatic commit. Thu Aug 30 20:03:12 WST 2012

"Not Hercules could have knock'd out his brains, for he had none."
-- Shakespeare

Add QFT assignments

Dear Git,

Blergh

Yours Quantumly,
Sam

Automatic commit. Thu Aug 30 16:00:07 WST 2012

Sheriff Chameleotoptor sighed with an air of weary sadness, and then
turned to Doppelgutt and said 'The Senator must really have been on a
bender this time -- he left a party in Cleveland, Ohio, at 11:30 last
night, and they found his car this morning in the smokestack of a British
aircraft carrier in the Formosa Straits.'
-- Grand Panjandrum's Special Award, 1985 Bulwer-Lytton
   bad fiction contest.

Automatic commit. Thu Aug 30 12:00:10 WST 2012

Q: Why do mountain climbers rope themselves together?
A: To prevent the sensible ones from going home.

Automatic commit. Thu Aug 30 08:00:15 WST 2012

There is no character, howsoever good and fine, but it can be destroyed by
ridicule, howsoever poor and witless.  Observe the ass, for instance: his
character is about perfect, he is the choicest spirit among all the humbler
animals, yet see what ridicule has brought him to.  Instead of feeling
complimented when we are called an ass, we are left in doubt.
-- Mark Twain, "Pudd'nhead Wilson's Calendar"

Automatic commit. Thu Aug 30 04:00:08 WST 2012

You mentioned your name as if I should recognize it, but beyond the
obvious facts that you are a bachelor, a solicitor, a freemason, and
an asthmatic, I know nothing whatever about you.
-- Sherlock Holmes, "The Norwood Builder"

Automatic commit. Thu Aug 30 00:00:05 WST 2012

Today is National Existential Ennui Awareness Day.

Automatic commit. Wed Aug 29 20:00:05 WST 2012

Q: What do you call a WASP who doesn't work for his father, isn't a
lawyer, and believes in social causes?
A: A failure.

Automatic commit. Wed Aug 29 16:00:06 WST 2012

The first thing we do, let's kill all the lawyers.
-- Wm. Shakespeare, "Henry VI", Part IV

Automatic commit. Wed Aug 29 12:00:12 WST 2012

Seeing that death, a necessary end,
Will come when it will come.
-- William Shakespeare, "Julius Caesar"

Automatic commit. Wed Aug 29 08:00:05 WST 2012

Be careful!  Is it classified?

Automatic commit. Wed Aug 29 04:00:05 WST 2012

You have a strong appeal for members of the opposite sex.

Automatic commit. Wed Aug 29 00:00:04 WST 2012

You will be run over by a beer truck.

Automatic commit. Tue Aug 28 20:00:12 WST 2012

Q: What do you call a blind pre-historic animal?
A: Diyathinkhesaurus.

Q: What do you call a blind pre-historic animal with a dog?
A: Diyathinkhesaurus Rex.

Automatic commit. Tue Aug 28 16:00:07 WST 2012

Swerve me?  The path to my fixed purpose is laid with iron rails,
whereon my soul is grooved to run.  Over unsounded gorges, through
the rifled hearts of mountains, under torrents' beds, unerringly I rush!
-- Captain Ahab, "Moby Dick"

Automatic commit. Tue Aug 28 12:00:05 WST 2012

You enjoy the company of other people.

Automatic commit. Tue Aug 28 08:00:11 WST 2012

You will have good luck and overcome many hardships.

Automatic commit. Tue Aug 28 04:00:04 WST 2012

... A solemn, unsmiling, sanctimonious old iceberg who looked like he
was waiting for a vacancy in the Trinity.
-- Mark Twain

Automatic commit. Tue Aug 28 00:00:04 WST 2012

In the Spring, I have counted 136 different kinds of weather inside of
24 hours.
-- Mark Twain, on New England weather

Automatic commit. Mon Aug 27 20:00:02 WST 2012

You will live to see your grandchildren.

Automatic commit. Mon Aug 27 16:00:05 WST 2012

Tomorrow, this will be part of the unchangeable past but fortunately,
it can still be changed today.

Automatic commit. Mon Aug 27 12:00:12 WST 2012

Tuesday After Lunch is the cosmic time of the week.

Time dependence of stuff

Dear Git,

So the emission current is definately not constant. And appears to vary quite a lot with pressure in the chamber.
Yep.

Supervisor: "The emission current will be constant. I don't think such a small change in pressure will affect it."
Supervisor: "There is probably no need to measure the pressure of the chamber"

I can only hope that this message reaches you in time git, for my sanity is beginning to wane.

Yours annoyedly,

Sam

Automatic commit. Mon Aug 27 08:00:13 WST 2012

You recoil from the crude; you tend naturally toward the exquisite.

Automatic commit. Mon Aug 27 04:00:05 WST 2012

Delores breezed along the surface of her life like a flat stone forever
skipping along smooth water, rippling reality sporadically but oblivious
to it consistently, until she finally lost momentum, sank, and due to an
overdose of flouride as a child which caused her to suffer from chronic
apathy, doomed herself to lie forever on the floor of her life as useless
as an appendix and as lonely as a five-hundred pound barbell in a
steroid-free fitness center.
-- Winning sentence, 1990 Bulwer-Lytton bad fiction contest.

Automatic commit. Mon Aug 27 00:00:05 WST 2012

You'll never be the man your mother was!

Automatic commit. Sun Aug 26 20:00:13 WST 2012

If you learn one useless thing every day, in a single year you'll learn
365 useless things.

Automatic commit. Sun Aug 26 16:00:10 WST 2012

Q: What do you call a half-dozen Indians with Asian flu?
A: Six sick Sikhs (sic).

Automatic commit. Sun Aug 26 12:00:10 WST 2012

You're ugly and your mother dresses you funny.

Automatic commit. Sun Aug 26 08:00:10 WST 2012

An honest tale speeds best being plainly told.
-- William Shakespeare, "Henry VI"

Automatic commit. Sun Aug 26 04:00:09 WST 2012

Never look up when dragons fly overhead.

Automatic commit. Sun Aug 26 00:00:07 WST 2012

For courage mounteth with occasion.
-- William Shakespeare, "King John"

Automatic commit. Sat Aug 25 20:00:09 WST 2012

A man was reading The Canterbury Tales one Saturday morning, when his
wife asked "What have you got there?"  Replied he, "Just my cup and Chaucer."

Automatic commit. Sat Aug 25 16:00:12 WST 2012

Q: How do you keep a moron in suspense?

Automatic commit. Sat Aug 25 12:00:42 WST 2012

Don't relax!  It's only your tension that's holding you together.

Automatic commit. Sat Aug 25 08:00:43 WST 2012

There are three infallible ways of pleasing an author, and the three form a
rising scale of compliment: 1, to tell him you have read one of his books; 2,
to tell him you have read all of his books; 3, to ask him to let you read the
manuscript of his forthcoming book.  No. 1 admits you to his respect; No. 2
admits you to his admiration; No. 3 carries you clear into his heart.
-- Mark Twain, "Pudd'nhead Wilson's Calendar"

Automatic commit. Sat Aug 25 04:00:04 WST 2012

Q: How did you get into artificial intelligence?
A: Seemed logical -- I didn't have any real intelligence.

Automatic commit. Sat Aug 25 00:00:08 WST 2012

October 12, the Discovery.

It was wonderful to find America, but it would have been more wonderful to miss
it.
-- Mark Twain, "Pudd'nhead Wilson's Calendar"

Automatic commit. Fri Aug 24 20:00:09 WST 2012

The last thing one knows in constructing a work is what to put first.
-- Blaise Pascal

Automatic commit. Fri Aug 24 16:00:10 WST 2012

A Tale of Two Cities LITE(tm)
-- by Charles Dickens

A man in love with a girl who loves another man who looks just
like him has his head chopped off in France because of a mean
lady who knits.

Crime and Punishment LITE(tm)
-- by Fyodor Dostoevski

A man sends a nasty letter to a pawnbroker, but later
feels guilty and apologizes.

The Odyssey LITE(tm)
-- by Homer

After working late, a valiant warrior gets lost on his way home.

Automatic commit. Fri Aug 24 12:00:03 WST 2012

You are fighting for survival in your own sweet and gentle way.

Automatic commit. Fri Aug 24 08:00:10 WST 2012

You shall be rewarded for a dastardly deed.

Automatic commit. Fri Aug 24 04:00:08 WST 2012

I was gratified to be able to answer promptly, and I did. I said I didn't know.
-- Mark Twain

Automatic commit. Fri Aug 24 00:00:07 WST 2012

O, what a tangled web we weave, When first we practice to deceive.
-- Sir Walter Scott, "Marmion"

Automatic commit. Thu Aug 23 20:00:08 WST 2012

Things past redress and now with me past care.
-- William Shakespeare, "Richard II"

Automatic commit. Thu Aug 23 16:00:08 WST 2012

Don't hate yourself in the morning -- sleep till noon.

Automatic commit. Wed Aug 22 16:00:04 WST 2012

For courage mounteth with occasion.
-- William Shakespeare, "King John"

Automatic commit. Wed Aug 22 12:00:05 WST 2012

Everything will be just tickety-boo today.

Process fast sweeps

Dear Git,

The fast sweeps appeared similar to each other.
I thought this was a good sign.
But then I took the derivative.

Yours screwed,
Sam

Graph the latest set of sweeps on one graph

Dear Git,

How are you?

I have normalised currents to the max value and made a graph.

It Doesn't look very good.

I Will try normalising to emission current later.
But emission current didn't seem to change much.
So it will probably still look shit.

Will try doing faster sweeps after the latest one finishes.

Yours doomedly,
Sam

PS: God dammit

Automatic commit. Wed Aug 22 08:00:08 WST 2012

Do nothing unless you must, and when you must act -- hesitate.

Automatic commit. Wed Aug 22 04:00:04 WST 2012

O, what a tangled web we weave, When first we practice to deceive.
-- Sir Walter Scott, "Marmion"

Automatic commit. Wed Aug 22 00:00:04 WST 2012

Q: Why should you always serve a Southern Carolina football man
soup in a plate?
A: 'Cause if you give him a bowl, he'll throw it away.

Automatic commit. Tue Aug 21 20:00:06 WST 2012

You will remember something that you should not have forgotten.

Automatic commit. Tue Aug 21 16:00:08 WST 2012

A is for Apple.
-- Hester Pryne

Automatic commit. Tue Aug 21 12:00:02 WST 2012

So you're back... about time...

Automatic commit. Tue Aug 21 08:00:05 WST 2012

"I understand this is your first dead client," Sabian was saying.  The
absurdity of the statement made me want to laugh but they don't call me
Deadpan Allie and lie.
-- Pat Cadigan, "Mindplayers"

Automatic commit. Tue Aug 21 04:00:03 WST 2012

He jests at scars who never felt a wound.
-- Shakespeare, "Romeo and Juliet, II. 2"

Automatic commit. Tue Aug 21 00:00:02 WST 2012

Condense soup, not books!

Automatic commit. Mon Aug 20 20:00:03 WST 2012

The naked truth of it is, I have no shirt.
-- William Shakespeare, "Love's Labour's Lost"

Automatic commit. Mon Aug 20 16:00:10 WST 2012

You possess a mind not merely twisted, but actually sprained.

Initial tests of processing (calculate dI/dE)

Uncalibrated.

You know what? These results look like *SHIT*.

Automatic commit. Mon Aug 20 12:00:04 WST 2012

Don't look now, but there is a multi-legged creature on your shoulder.

Automatic commit. Mon Aug 20 08:00:13 WST 2012

Q: What do you get when you cross the Godfather with an attorney?
A: An offer you can't understand.

Automatic commit. Mon Aug 20 04:00:04 WST 2012

You have Egyptian flu: you're going to be a mummy.

Automatic commit. Mon Aug 20 00:00:04 WST 2012

It is by the fortune of God that, in this country, we have three benefits:
freedom of speech, freedom of thought, and the wisdom never to use either.
-- Mark Twain

Automatic commit. Sun Aug 19 20:00:08 WST 2012

Wagner's music is better than it sounds.
-- Mark Twain

Fix