Adding module tree to git, added SYS_LOADMOD to allow usermode module loading

Multiple changes (Module Interopability, Timers, FDD Driver, VFS Bugs)

- Changed kernel to be compiled withough -fleading-underscore to allow
  modules to be statically linked with the kernel successfully.
- Moved the BochsVBE driver to the Modules tree
- Cleaned up and disabled debug in the FDD driver
- Fixed bugs in VFS_MkNod that caused an infinite loop
- Cleanup in FAT and EXT2 Drivers

Added the gitignore file to stop object and dependency files showing up

Various Changes

- Double fault protection
- Optomised Memory Functions (also added memcmp)
- Added worker threads
- Fixes to the timer code (stop the RTC firing at 1024 Hz)
- Re-included the FDD driver
- Moved the NE2000 driver to /Modules
- Inconcequential changes to system.c
- Added block allocation to fs/ext2
- Changed the makefiles to support static linking of modules

Fixed network triple fault, packets now send successfully.
Changed RTC to fire at 4 Hz, instead of 1024Hz
Slight changes to EXT2, library functions and IRQ handling

Implemented basic disk write support in EXT2.
Fixed Debug_HexDump bug.
Made changes to NE2000 driver (now triplefaults on write, instead of doing nothing

Fixed the RTC only firing once.
Also added the <acess/devices.h> usermode header that will be used by the GUI

Added Driver Utils to git tree

Cleaned up ATA driver (not only 3 functions in the Read chain, instead of 4)

Fixed Infinite reading in ext2 driver, removed debug from DrvUitl

Fixed Triple Fault in EXT2 driver/hdd driver

Various Changes
- Fixes to network driver (still doesn't work)
- Added EXT2 Driver (required changes to HDD driver and VFS Driver interface)
 > Seems to cause a Triple Fault
- Features and bugfixes for libc
- Implemented alternative directories for libraries in ld-acess
- Implemented usermode mount support (no unmount yet)

Enabled WP flag in CR0 to allow COW to work if the kernel writes to the page
Fixed handling of . and ..

Fixed correctness in stdio, minor changes in ls to handle dirs with negative sizes

Fixed bug where system would lock if a user task segfaulted (forgot to sti)
Cosmetic fix to login shell
Ignored tabs in CLI Shell

Fixed bug with handling of . and .. that was trashing the heap. Fixed soname of libgcc to libgcc.so instead of libgcc.acess.so

Cleanup
- Unified the build systems for user and kernel space code
- Fixed bug in VFS when VFS_Open is called by user when the current working directory is NULL
- Added testing EXT2 and NE2000 drivers
- Added files forgotten in the FDD commit

Added sanity checking to VFS_OPEN

Removed Page directory dump, added a mention of the fault details before the table dump. Added qsort function to libc

Disabled the FDD driver

Actually initialised the DMA

Added DMA and FDD drivers to the tree

Added Timer functions, DMA Driver and FDD driver

Fixed CLIShell's `dir` command, added a logout/exit command. Added a newline after a failed login prompt

Updated the CLI Shell to use the new path, adding login to git

Fixed Segfault if execve fails, fixed errors in LibC pertaining to stdin,... not being set

Implemented debug SYS_SETUID and SYS_SETGID (need to actually make them)

Verbosity in MM_PageFault for user Pagefaults

Immense cleanup of libc, implemening login program. Slight changes to ACL handling and FAT driver

Porting FIFO driver

Started work on VTerm Fonts, slight changes to BochsVBE driver

Debug

Fixed invalid parameters passed to Threads_Exit by SYS_EXIT

Debug

Cut down on debug, fixed tabs, made process tree be killed when root is killed

Removed debug (VFS_GetAbsPath seems to be stable)

fixed EOS calculation

testing

testing

Testing

Testing

Bugfixes, bugfixes, bugfixes

Fixed string being copied offset

Made it _look_ like the leading / is included

Included leading / in path parsing

Fixed offset issue with slashNum

Correctness Fix: Stuff speed, now parses CWD with the rest of the path to fix issues with relative paths

Fixed: Used pos-increment instead of pre-increment

Debug

Fixed use of `pos` instead of `read` in first slash positions

Fixed strncmp

Debug

Debug

Debug

Fixed incorrect use of strpos

Fixed: Not adding a trailing slash to CWD in VFS_GetAbsPath

Remove debug & add Debug

Fixed: Moved back to using symbolic keys for states

Fixed: Increased key states array to accomidate full range

Debug

Debug

Debug

Fixed duplicate reference of heap locatons, and stopped CWD from being freed if it is currently NULL

Fixed VFS_ChDir to handle symlinks by using VFS_Open

Debug

Removed debug

Debug

Removed debug

Debug

Debug

Fixed FAT_Read to return number of bytes read. Created a simple `cat` command

Fixed SYS_READ and SYS_WRITE to return correct values

Disabled Debug

Fixed MM_ClearUser not zeroing cleared entries

Debug

Debug

Debug

Fixed bit arithmatic

Extended MM_Dump to dump table addresses

Changed user stack to be at 8M

Added catch for when rand() sticks

Changed random values again

Changed the random values A and C

Debug statement in rand()

Added tracing of ticket draws

Moved adding a task to the active list to threads.c

Added debug to Threads_GetNext

Added tracing of task switches

Cut down on debug

Invalidated page that has just been marked COW

Helps if DEBUG is defined

Added debug to MM_PageFault

Fixed MM_PageFault duplicating a page when it is only used once

Added magic breakpoint to SYS_CLONE, cleaned up other debug

Strike that

Fixed stack changing in SYS_CLONE

Disabled debug in binary loader and added sleeping message

Turned debug on for binary loader to trace Proc_Execve

Extra debug in Idle thread

Debug in Proc_Clone