doxygen fixes

More work on TCP, Connection is successfully established, but problemw with ACKing packets.
- RST is sent after ACKing first data packet.
- Also did some changes to Debug_DumpHex and Threads_Get*

Bugfixing and testing TCP stack
- Also fixed build process

More work on TCP, untested and almost complete

More work on TCP, approaching usable (untested)

Cleanup commit, fixes to UDP, TCP and ICMP
- Basicly cleaning up commented out code and potential bugs
- More work on TCP support

Removed debug from Network/NE2000/ne2000.c

UDP Packets are now sent and recieved correctly (server not tested)
- Also did some work on USB, only minor.
- Fixed a bug in IPStack/link.c that passed a non-aligned packet to the interface.
- Fixed channel being skipped if the IP _matches_ (should be skipped if it doesn't)
"Yo dawg, I heard you liek packets, so I sent you one"

More fixups to ARP and UDP (udp still buggy)

Working on UDP, removed debug from some code, fixed ARP setting hwtype to 0x100 (should be 1)
- Other Misc changes

More work on TCP, splitted UDI arch dependent out of udi.h, slight work on AxWin

More work on TCP, still not usable

Work on IP/TCP Stack
- TCP now registered with IPv4
- Added debug code and started on TCP server support
- Fixed bitfield error (removed the bitfields for portability)

Helps if I add it to the main makefile

Removed the need to alter acess.ld for each build environment

More work on IPStack, TCP and UDP slowly moving along

Cleanups that will hopefully allow compilation in more strict environments

Fixed and improved Ping support
- BUG: ARP requests time out for some reason, todo check on other networks
- Also updated the readme for better support when building

More work on the IP Stack, now responds to pings
- Also fixed bug in NE2000 driver that resent the first packet
  on each subsequent send.

Fixed IPStack's ID showing as IDENT

More additions

Cleaning up unadded files

Working on GUI, side changes to the message passing

Reorganised the modules directory, started serious work on GUI support
- Cleaning up and bugfixing VTerm graphics support

Altered & Renamed LookupString, Added DrvUtil_SetIdent
- Both now check the user memory before using it

I really need to learn to compile test before commiting

Updated gitignore rules, cleaned up MBR parsing

Started splitting ATA driver into separate files

Renamed ATA core to main.c

Moved ATA driver out of Kernel tree
- Also changed VER3 macro to VER2 for compatability with MODULE_DEFINE

Bugfixes and debug cleanup
- Cleanup in threads.c
- Fixed ACL/Permissions bugs in VFS
- Also fixed instaces where tVFS_Node methods were called without NULL checking

Multi-user testing and bugfixing
- Actually changes the UID now
- Added stub normal user 'tpg', no password

More debug in PE loader

Exteding Driver interface
- Changed 4-byte ID to a 31 byte string (32 with NULL terminator)
- Created a macro for the version numbers

Comment/documentation change to the VFS

Fixes and logging

Changes and Features to IPStack
- Added 'ping' ioctl and required calls, currently incomplete

Adding PE file support
- Also added binary register function (now modules can handle binary files)

Added support for dynamic registration of module loaders
- Also updated .gitignore to exclude more object files
- UDI is now a dynamic module

Adding `udisetup` (and required linker script)

Slight changes to UDI structures and logging

Fixed Double-Relocation in modules.c (edited bin/elf.c to find this)

More work on UDI, cleanup and pseudod should now load.
- Also added a NULL check to ELF_GetSymbol

Added cb.o to the UDI objects list

More UDI work
- GIO Metalanguage
- CB Functions
- Also added the UNIMPLEMENTED() macro for unimplemented functions

More work on UDI support

More work on UDI support, still doesn't load pseudud yet
- Also fixed the FAT ReadDir bug (bad treatment of SPC==1)

Bugfixes and UDI Updates
- Added UDI to the tree
- Bugfixing FAT filesystem (Fixed EOC handling in FindDir)
 > Still a bug in ReadDir that causes garbage to be read

Ok, this was embarrassing... Added core include file that was renamed
- include/acess.h was renamed (from include/common.h) several commits
  ago and I forgot to add it.

More work on UDI, Added more Login VTerms

Bugfixes, Cleanup and Rewite started on UDI interface
- Fixed bug in mm_virt where the kernel (as 0-1MiB) was being marked COW
  (hence triple faulting)
- Cleaned up /Makefile (now only builds kernel and modules with no target)
- Started rewriting the UDI system

Fixed a bug that caused physical memory allocation to be one-time use

SMP Work (APs now start, just seem to lock up on lgdt, or whatever is at that address)
- Also added support for setting the build architecture in the environment
- Included the Doxygen layout file

More SMP Work, also changed the physical allocator to allocate downwards

Working on Multiprocessing support
- Cleaned up SysFS debug
- Fixed ByteSum() (now returns a byte)
- Added character array functionality to %c (%Nc will print N chacters from the passed array)

Added debug code to vterm, fixed userland _errno support

Starting on PAE support, removed UDI from kernel

More work on UDI, attempting to get it to load the pseudod driver

Changed "common.h" to "acess.h" to reduce possible conflicts

Attempting to fix an intermittent TSS bug

Cleaned up some more debug

Cleanup & Debug Removal
- Disabled debug in ATA driver
- Fixed the return values of module initialisation functions
- Cleaned up some newlines that were still around in Log() calls

Added flag to enable/disable debug symbols in the kernel
- `export DEBUG_BUILD=yes` will enable a debug build, any other value
  will disable DWARF debug.

Changed the x86 architecture to have tPAddr be 64-bits always
- tPAddr being a constant size allows PAE to be selected at
  runtime (when I complete it :))
- Related bugfixes (where tPAddr was assumed to be 32-bits)
- Also fixed bugs in the config file parser
- Added -g flag to the build (working on a disable switch)

Revamped the config file parsing to be more resiliant to errors.

Bugfixes upon chaning GCC versions
- Also updating my config to be correct for my new machine

Working on UDI support (UDI manager module now compiles)
- DEBUG ONLY

Fixed bug in Inode_ClearCache

Updated build system to remove `install` from `all`
- Also created a common makefile for Usermode/Applications to reduce make bugs
- Updated Inode_ClearCache to actually delete the cache correctly (thanks SmSpilaz)

Update to readme relating to the filesystem generation

Added Filesystem generation and required $(x*) variables

Updated the build files to use $(xCP), allows use of mcopy to a mtools disk

Big Changes - See commit details
- Cleaned up and fixed kernel API Documentation
- Removed drvutil.h and moved it's definitions to tpl_drv_disk.h
- Changes to the VFS and Driver specs (only minor)
- Fixed behaviour of loader when a module doesn't initialise
- Fixed some modules returning zero when they successfully loaded
- Other changes to fix doxygen generation

Altered keyboard driver to correctly support Unicode
- Updated Keyboard and VTerm driver to accomodate this
- Edited Modules/Makefile.tpl to allow modules to set their own CPPFLAGS
- Inconcequential changes elsewhere

More work on IPStack (Also fixed Proc_SpawnWorker)
- Fixed structures in IPStack not being packed
- Fixed instances when byte orders were not handled
- Added stub UDP support
- Added copious ammounts of debug code to IPStack
- Added packet reception to NE2000 driver
- Changed autoconf in ifconfig to set the IP to 10.0.0.55

Added ProcDev/SysFS + Cleanup
- Added /Devices/system (ProcDev or SysFS)
 > Allows exposing of kernel buffers to usermode (readonly)
- Added use of ProcDev to VFS to expose Mounted filesystems and loaded
  filesystems.
- Created tSpinlock type to make sure that spinlocks are volatile

Cleanup and Bugfixing
- Created a _very_ basic `ifconfig` app to test the IPStack module
- Fixed a bug in MM_NewWorkerStack that caused it to always fail
- Added the LEAVE_RET macro to simplify debugging
- Moved BochsGA driver to module tree
- More work on the IPStack
- Fixed compile errors in NE2000 driver
- and did some work on the makefiles

Cleanup and Bugfixes
- Fixed bugs with handling of SYS_READ and SYS_WRITE
- Added EXPORT definitions to functions used by the IPStack
- Updated the core Makefile to use loops to allow easier maintainence
- Fixed bug in IPStack/main.c (Null pointer dereference)
- Cleaned up some of the debug code

Cleanups & Implementations to allow IPStack to compile
- IPStack module now compiles (still unusable)
- Added Network Device spec file (tpl_drv_network.h)
- Shuffled definitions between vfs.h and vfs_ext.h
- Added thorough sanity checking to System calls (except IOCtl as
  the driver is the only code that knows what it means)
- Cleaned up makefiles to delete Dumps and Disassemblies
- Added USB core file to tree
- Implemented DRV_IOCTL_LOOKUP and NET_IOCTL_GETMAC in NE2000 driver
  in prepararion for IPStack.

Fixed implementation of ChRoot
(it could be bypassed by using ..)

Forgot to build test :S Added defintion of CFG_VFS_CHROOT

Added ChRoot Support (untested)

Fixes and Cleanup
- Fixed text mode in BochsGA driver and hence set it to the VTerm default
- Moved Ext2 Filesystem driver to Modules tree (As FS_Ext2)
- Included root Makefile in git tree
- Slight changes to the in-process USB code
- Updated the README
- Inconcequential changes to other files

Adding several modules to the Tree, plus some files that escaped earlier
- Added the in-progress IP Stack
- Added the in-progress USB Stack
- Added module's linker script
- Added tpl_drv_terminal.h (Terminal Emulator defintions)
- Added libreadline (my own version)
- Added Usermode/stddef.h

General Cleanup, Implemented DMA Allocation
- Cleaned up debugging and added notice of loading a module
- Added doxygen comments to common.h
- Fixed the dynamic modules not loading due to a buggy linker script
- Added MM_AllocDMA to allow memory of a specific bit depth to be allocated
- Various bugfixes and export adds

Added Doxygen files

Added IO Cache Library, Moved FDD Driver to Modules Tree, Fixed Doxygen commenting

Implemented Dependency resolving for compile-time modules and Updated the README
- Added more early debug code (See arch/.../errors.c)
- Added dependencies to drivers
- Implemented dependcy resolving in modules.c
- Disabled FAT chaching and fixed bugs that showed
- Updated README to show how to configure and build

Improved VTerm support
- Fixed VTerm changing (Ctrl-Alt-F[1-12] sets the Vterm to 0-11)
- Made the kernel output to VTerm 7 after loading drivers
- Added 'calloc' to clean up VTerm code

Fixes to Libc, Doxygen Comments and VTerm layout
- Fixed Libc so that zlib could compile against it (still some bugs to get rid of)
- Fixed doxygen commenting
- Fixed a bug in the Makefile (used %* instead of $*)
- Changed the structure of the VTerm driver to facilitate kernel modesetting properly

Adding module tree to git, added SYS_LOADMOD to allow usermode module loading

Multiple changes (Module Interopability, Timers, FDD Driver, VFS Bugs)

- Changed kernel to be compiled withough -fleading-underscore to allow
  modules to be statically linked with the kernel successfully.
- Moved the BochsVBE driver to the Modules tree
- Cleaned up and disabled debug in the FDD driver
- Fixed bugs in VFS_MkNod that caused an infinite loop
- Cleanup in FAT and EXT2 Drivers

Added the gitignore file to stop object and dependency files showing up

Various Changes

- Double fault protection
- Optomised Memory Functions (also added memcmp)
- Added worker threads
- Fixes to the timer code (stop the RTC firing at 1024 Hz)
- Re-included the FDD driver
- Moved the NE2000 driver to /Modules
- Inconcequential changes to system.c
- Added block allocation to fs/ext2
- Changed the makefiles to support static linking of modules

Fixed network triple fault, packets now send successfully.
Changed RTC to fire at 4 Hz, instead of 1024Hz
Slight changes to EXT2, library functions and IRQ handling

Implemented basic disk write support in EXT2.
Fixed Debug_HexDump bug.
Made changes to NE2000 driver (now triplefaults on write, instead of doing nothing

Fixed the RTC only firing once.
Also added the <acess/devices.h> usermode header that will be used by the GUI

Added Driver Utils to git tree

Cleaned up ATA driver (not only 3 functions in the Read chain, instead of 4)

Fixed Infinite reading in ext2 driver, removed debug from DrvUitl